花菁染料是核酸染料的一种,具有摩尔吸收系数大和荧光量子产率高的优点.通过共轭链长度的调节,花菁的光谱可以从可见光区一直延伸到近红外区,采用红区测量可有效地排除背景干扰,获得更为理想的分析灵敏度和选择性.花菁染料的光谱对外界微环境的变化极为敏感,非常适合生物及环境样品的分析研究.方酸菁染料一类荧光强度高的有机染料,主要分布在红色和近红外区域(在630 - 670 nm之间有吸收峰,在650-700 nm之间有发射峰).他们的特点是其独特的芳香族四元环系统派生的平方酸.大多数的四元环受到高度缺电子的中心四元环的亲核攻击.这种阻碍可以通过在染料周围形成轮烷来减弱,以保护它不受亲核试剂的影响.

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